冷藏集裝箱裝貨后應檢查冷藏或冷凍貨的原有質量，并在貨單上加以說明。在裝箱過程中，應嚴格裝貨堆碼原則，避免冷風短路造成降溫不平衡，降低制冷裝置的制冷效率。長距離運輸時，箱內設定溫度與實際溫度差不能過大。運送新鮮水果、蔬菜等，應及時打開通風口，進行通風換氣。
使用二手冷藏集裝箱運輸時，安全穩定性非常重要。二手冷藏集裝箱往往很重，人力拿不起，運輸中必須滿足加重設備和其他運輸設備的要求。它也因為它的重量，往往會引起重心臟中運輸設備的不穩定，所以在端角使用保護包裝，以免容器被抓撓，引起變形。
冷藏集裝箱的功能特點 1.耐高溫耐冷：冷藏集裝箱耐溫耐寒性規定較高，在高溫水中不易形成 2.耐久性：冷藏集裝箱租賃公司的冷藏車應具備優良的抗沖擊性。壓力或碰撞時不易破裂，不易留下劃痕，可終身應用。 3.密封性：主要考慮選擇冷藏車。雖然知名品牌的商品密封性方法不同，但密封性是長期冷藏集裝箱運行記憶食材的常備條件 4.冷藏：國際上密封性測量規范是通過測量透過環境的濕度來鑒定的。質量好的冷藏集裝箱比同行的通透環境濕度低200倍，長期保持工作新鮮。 5.生態性、多元性：對生活需求的設計方案尺寸不同，多次重復使用高新技術醫用冰袋，使用醫用冰袋可以防寒保溫。
